Bộ máy của Trường Đại học Kiểm sát Hà Nội gồm có:

• Hiệu trưởng: TS. Kiểm sát viên Cao cấp. Lại Viết Quang
• Các phó hiệu trưởng:
  PGS. TS. Kiểm tra viên Cao cấp. Vũ Thị Hồng Vân;
  TS. Kiểm sát viên Cao cấp. Mai Đắc Biên;
  TS. Kiểm sát viên Trung cấp. Nguyễn Đức Hạnh.

• Khoa Lý luận chính trị;
• Khoa Nhà nước và pháp luật;
• Khoa Pháp luật hình sự và thực hành quyền công tố, kiểm sát hoạt động tư pháp trong lĩnh vực hình sự (Khoa pháp luật hình sự và kiểm sát hình sự);
• Khoa Pháp luật dân sự, hành chính và kiểm sát các hoạt động tư pháp trong lĩnh vực dân sự, hành chính (Khoa pháp luật dân sự và kiểm sát dân sự);
• Khoa Tội phạm học và Điều tra tội phạm;
• Khoa Pháp luật quốc tế.
• Khoa Đào tào, bồi dưỡng Cán bộ Kiểm sát

• Phòng Tổ chức –Hành chính;
• Phòng Đào tạo và Quản lý sinh viên;
• Phòng Quản lý khoa học và Hợp tác quốc tế;
• Phòng Quản trị;
• Phòng Tài vụ.

• Trung tâm Thông tin -Thư viện;
• Trung tâm Bảo đảm chất lượng đào tạo.